Εκτός από το συντονισμό των δραστηριοτήτων των Κοινοτήτων-μελών της και την εκπροσώπηση των συμφερόντων τους η Ομοσπονδία έχει τους ακόλουθους στόχους:
• την προώθηση της πολιτικής, κοινωνικής και πολιτιστικής ενσωμάτωσης και συμμετοχής των ελλήνων μεταναστών
• την οργάνωση και υλοποίηση πολιτικών ενσωμάτωσης  για τη βιώσιμη βελτίωση των συνθηκών διαβίωσης των ελλήνων μεταναστών
• την ενίσχυση και ενεργοποίηση της κοινωνικής συμμετοχής των μελών της
• την προώθηση της κουλτούρας καλωσορίσματος και αναγνώρισης, του διαπολιτισμικού διαλόγου και των διαπολιτισμικών διαδικασιών ανοίγματος εντός και εκτός των δομών της Ομοσπονδίας
• την ανάπτυξη και διάδοση προτάσεων και στρατηγικών  λύσεων  σε όλους τους τομείς δραστηριοτήτων